仪器科学与工程学院所属学科专业创建于1960年，原名陀螺仪及导航仪器专业，于1961年开始招收研究生。1981年和1984年被国务院学位委员会先后批准设立“精密仪器及机械”和“测试计量技术及仪器”两个硕士学位授权点。

1990年被批准设立“精密仪器及机械”博士学位授权点。1992年5月为了适应学科发展需要，从自动控制系分出成立了仪器科学与工程系。2006年9月学校批准成立仪器科学与工程学院。

“精密仪器及机械”学科1994年被评为江苏省重点学科，2006年被评为江苏省国家重点学科培育点，1998年被国务院批准为“仪器科学与技术”一级学科博士、硕士学位授权点，1999年获准设立“精密仪器及机械”学科特聘教授岗，可聘长江学者奖励教授2名。

学院现有1个本科专业“测控技术与仪器”，拥有1个一级学科博士学位授权点“仪器科学与技术”，4个二级学科博士学位授权点：“精密仪器及机械”、“测试计量技术及仪器”、“微系统与测控技术”、“导航、制导与控制”。本学院还设有“仪器科学与技术”一级学科博士后科研流动站。

学院在老一代学科带头人万德钧教授、黄惟一教授、翟羽健教授、周百令教授等带领下，坚持以学科建设为龙头、以队伍建设为核心、以基地建设为保障，通过精心规划和努力建设，目前已形成了一支以长江学者特聘教授和江苏省“333”工程学术带头人为核心，以博士生导师为骨干的高水平师资队伍。学院现有教职工66人，其中专职教师56人，教授21人（含长江学者特聘教授1人，博士生导师18人）、副教授25人。具有国内外博士学位的教师占专任教师的91%。教师队伍中，有中国青年科技奖获得者1人、教育部“高校青年教师奖”获得者和新世纪人才2人，教育部青年骨干教师3人，江苏省“333”工程学术带头人5人，江苏省“青蓝工程”跨世纪学术带头人3人，江苏省“六大高峰人才”5人。

学院现建有“微惯性仪表与先进导航技术”教育部重点实验室、“远程测控技术”江苏省重点实验室和“土地实地调查监测技术”国土资源部重点实验室。此外学院还参与建设一个国家工程研究中心和一个教育部重点实验室。

截止2012年4月，本学科已招收培养博士生350多名，硕士生1000多名，本科生近3000名。

学院的总体学科水平、人才培养和科研实力在国内同类学科中走在前列，某些研究领域接近或达到国际先进水平。