东南大学公共卫生学院，建立于1976年，其前身为铁道部所属的原南京铁道医学院预防医学系，1999年更名为南京铁道医学院公共卫生学院，是全国铁路系统卫生防疫工作人才培养和科学研究的重要基地。2000年4月，南京铁道医学院与教育部直属的重点大学----东南大学合并，组建新的东南大学，公共卫生学院成为东南大学下设的二级院系之一。并校以来，学院秉承百年名校—东南大学“止于至善”的办学理念，发挥东南大学以工为主，多学科交叉融合的资源优势，积极探索走医工结合、精而强的特色发展之路。

南大学公共卫生学院位于东南大学丁家桥校区----原中央大学医学院的故址。学院的前身为铁道部属高校----原南京铁道医学院卫生系。1960年11月，经铁道部批准，原南京铁道医学院成立科学研究所，内设隧道卫生、放射卫生、近现代卫生分析化学等研究室。1976年，为适应铁路医疗卫生工作的需要，在铁道部的重视和支持下，医学院正式成立了卫生系，设立预防医学本科专业。主要承担为全国铁路系统培养卫生防疫工作专门人才和重点围绕铁路运输开展卫生工作科学研究的的任务。卫生系建立以来，培养的毕业生大部分分配在全国铁路各级医疗卫生单位，成为铁路卫生工作的管理和业务骨干。1995年，在铁道部的支持下，经原国家教委批准，卫生系在预防医学专业基础上，增设了了医疗保险专业。随着专业的发展和学科建设的需要，卫生系更名为公共卫生学院。

2000年4月，原南京铁道医学院与教育部直属的重点大学-----东南大学合并，南京铁道医学院公共卫生学院更名为东南大学公共卫生学院，成为东南大学下设的二级学院之一。依托东南大学文理管工医多学科交融的丰厚资源，公共卫生学院的发展，进入了一个新的阶段。

学院拥有一支数量结构较为合理的师资队伍。教师中，现有教授13人（博士生导师12人），副教授、研究生导师26人，其中担任国家自然基金评审委员2人，教育部教学指导委员会委员2人，江苏省333工程领军人才2人，全国高校优秀骨干教师1人，享受国务院特殊津贴6人，不少教师在省市各级学术团体担任重要职务。教师中近80%具有博士学历，50%以上具有海外留学或研修的经历。此外，学院还在国内外知名专家学者中聘请了一批兼职教授，客座教授。在省市疾病控制中心聘请了十余位研究生基地导师。

学院实施精英化教育，近几年来，学院适当控制本科生招生规模，大力发展研究生教育，不断提高办学层次和办学水平，现每年招收本科生100人，研究生50人（含博士）。学生在基础课阶段，提供以国家精品课程和省部级精品课程为主的优质教学资源，构建学生的通识教育基础平台。进入专业课以后，实行课堂理论教学与科研能力训练（SRTP）以及社会实践相结合的培养模式。此外还与国内外重点高校开展交换生，联合培养等，提高人才培养质量，努力实现研究型开放式国际化的办学目标

学院现设有预防医学专业（五年制）和劳动与社会保障专业（医疗保险专业方向，四年制）。预防医学专业是公共卫生学院的主干专业，设有劳动卫生与环境卫生，卫生毒理，放射卫生，营养与食品卫生，流行病与卫生统计，儿少妇幼卫生，卫生分析化学，社会医学与卫生管理等教研室，现为公共卫生与预防医学一级学科博士点和一级学科硕士点，公共卫生与预防医学博士后科研流动站，江苏省一级学科重点学科，也是教育部首批批准开展公共卫生硕士（MPH）培养试点单位之一。劳动与社会保障专业（医疗保险专业方向），建立于1995年，是国内最早开设医疗保险专业方向的专业。设有社会保障学硕士点。是江苏省重点建设的品牌特色专业。

学院设有4个学科系，即劳动卫生与环境卫生学系，营养与食品卫生学系、流行病与卫生统计学系及医疗保险学系。一个教学实验中心。有预防医学、铁路站车卫生、伤害流行病学、医疗保险、社务卫生服务及医学应用技术等6个研究所。

学院建有“环境医学工程”教育部重点实验室、江苏省生物材料与器件重点实验室、“环境与健康”教育部重点实验室

铁道部艾滋病检测中心、卫生部保健功能食品检测中心。此外，与江苏省CDC共建了1个省“135”工程重点试验室。实验室面积6000余平方米，各类仪器设备总值近3000万元。江苏省环境诱变剂学会理事长单位挂靠学院。

学院注重围绕国家和区域经济社会发展的公共卫生重大问题，积极开展科学研究，重点在环境与健康、纳米毒理、太湖水环境治理、健康膳食干预、重大传染病防治以及卫生政策研究等方面形成了稳定的研究方向。目前承担有国家973、863计划、国家自然基金，卫生部重大专项、科技部支撑计划以及省自然基金和国际合作课题等近100项。近五年来，获得纵向科研经费5000余万元，发表SCI、EI等高水平学术论文200余篇，发明专利已实现成果转化的10余项。

学院拥有教学科研用房6000余平方米，建有教学实验中心、计算机中心和分析检测中心以及SPF动物实验室，并建有“环境医学工程”教育部重点实验室、江苏省生物材料与器件重点实验室、铁道部艾滋病检测中心、卫生部保健功能食品检测中心。此外，与江苏省CDC共建了江苏省“135”工程流行病学重点实验室。现各类仪器设备总值近3000万元。江苏省环境诱变剂学会理事长单位挂靠学院。

学院积极开展国内外的学术交流，先后邀请美国、德国、澳大利亚以及香港、台湾等国家和地区的多所高校的著名专家学者来院访问交流，并积极选派青年教师前往国外著名高校访问研修，与香港大学公共卫生学院建立了院际交流合作关系，与澳大利亚蒙纳什大学公共卫生学院在联合培养方面开展了密切合作。

2009年，在教育部组织的全国高校与科研院所一级学科评估排名中，学院“公共卫生与预防医学”一级学科位列第9位。