哈工大是我国较早建立经济管理类专业的院校，20世纪40年代就建立了“铁路管理、工程经济、东方经济”等专业。20世纪50年代初通过前苏联专家的帮助，为全国等工科院校开展工程经济教育进行示范教学；1954年建立了“机械制造企业经济、组织与计划”和“动力企业经济、组织与计划”两个专业；1955年成立了“工程经济系”，是我国高等工科院校中第一个建立工程经济方面的科系。工程经济系在培养本科生和研究生的同时，还受教育部和有关部委的委托，为全国高等院校培养了大批管理专业师资，为有关部委培养了大批管理干部，使哈工大成为我国工程经济教育的摇篮，为我国管理教育的普及与发展做出了重要贡献。1978年改名为“管理工程系”。1984年8月，经国家教育部批准，成立了“哈尔滨工业大学管理学院”，是我国首批建立的4所管理学院之一，1986年获得“管理工程”专业博士学位授予权。哈尔滨建筑大学1980年设立了“建筑管理工程”专业，并组建了“建筑管理工程系”，是我国首批开展建筑管理工程本科教育和建筑经济及管理专业硕士生培养的院校之一，1993年成为我国唯一的建筑经济及管理博士学位授权单位，1999年成立哈尔滨建筑大学管理学院。2000年6月原哈尔滨工业大学与原哈尔滨建筑大学合校，两校的管理学院合并，组成了新的“哈尔滨工业大学管理学院”。

在50余年的发展历程中，学院在巩固原有优势的基础上，应对我国及世界变化的复杂环境，积极探索、发现管理领域新兴的研究问题及方向，在推动我国管理理论与实践的发展与创新上做了大量的工作，提出若干新的管理理论、方法与技术，使得若干研究领域或保持或达到国内领先水平，在国际上产生一定影响。

学院采取人才引进、自主培养和人才共享相结合的模式，通过有计划地引进海外人才和国内著名大学优秀博士；支持教师海外进修，提高国际学术交流能力；聘请海外知名学者担任兼职教授和兼职导师，建立国际化学术顾问制度和学术伙伴制度，设立创新人才建设项目，培养国际知名的学术带头人，建设起一支结构合理的高水平人才队伍。截止2009年12月，学院有教师140人，期中教授37人（含博士生导师30人），副教授72人，教师博士化率62%以上。

学院继承和发扬哈工大“规格严格、功夫到家”的光荣传统，在科学研究和学生培养中形成了比较完善的科研体系和教学体系，为国家培养了大量各层次、各种规格的高级管理人才。其中有的在国家部委、省、市的领导岗位上任职，有的成为国内知名的企业家，有的成为全国知名的管理学院、院士和学科带头人。截至2009年12月，在校学生共计3473人，其中：本科生998人，硕士生593人，博士生385人，在站博士后76人，高级管理人员工商管理硕士（EMBA）195人，工商管理硕士（MBA）570人，公共管理硕士（MPA）299人，工程硕士339人，外国留学生18人。

今后，管理学院还将继续努力，争取早日打造出一支具有国际竞争力的、学缘结构合理的学术团队；不断提升承担管理领域重大项目、解决重大科学问题的能力，不断提升培养管理领域拔尖人才的能力；把管理学院建设成一个开放式的、国际化的、有特色的一流管理科学研究、教学平台，培养出更多适应国家需要的、适应经济社会发展要求的管理人才。